組織システムにおいて、暗黙知的なところで組織や組織メンバーの基本的な思考・行動の仕方を規定している、仕事の作法やルール、ルーティン、思考・行動原則、価値観、理念などを総称して「組織OS」と呼んでいます。組織ごとに固有の組織OSがあり、異なる組織OS上では他社で成功した仕事の仕方やしくみ（アプリケーション）が全く機能しないということが生じます。
例えば、トヨタ生産方式を導入しても、根付かない、元に戻るという企業事例が多く見られますが、もともとその企業の組織OSが、トヨタの組織OSと大きく異なっていることが要因です。